新风系统竖向设计对运营管理会带来一些不利影响，假设10个新风立管由10个新风机组带，那么只要某一层住满了，而整栋楼入住率并不一定高，但是所有的5个新风机组就要全部开启。如果只开其中一两个立管的新风机组，那么每层都有顾客，对管理也造成一定不便。
不过这不是是非问题，设计时需要结合项目的情况进行权衡。