水源热泵对于湖水的影响主要是温度的影响，因为水源热泵对湖水的使用仅限于对湖水的冷热交换，并没有化学的处理或与有污染可能的物质接触。
温度的影响如果不慎重考虑，达到一定的影响可能会造成热污染，从而对湖内生物和水体造成影响。
湖水的温升要充分考虑到取水、排水口的位置，水体的面积、深度，水的流速，水面风速等各种因素，最终通过热容量的计算和湖水散热、吸热能力的计算确定对湖水温度的影响。